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石磊教授课题组
[ 作者:基础医学研究所(院)    来源自:本站原创    点击数:29261    更新时间:2016-10-26    文章编辑:wangluo ]

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课题组简介:本课题组1978年由潘华珍教授创建,主要从事膜脂膜蛋白相互作用分子机理及红细胞膜异常的血液病分子机理研究。取得了一系列研究成果。1993年许彩民教授接课题组后继续此方向的研究。2000年后转为肿瘤细胞凋亡与信号转导及基因表达与调控方面研究,取得了良好的研究成果,发表了一系列的SCI学术研究论文。2015年退休。2014年作为“协和学者”院校特聘教授, “青年千人”引进人才石磊教授进入本课题组,作为课题组长。目前实验室的主要研究方向为生物膜和膜蛋白的动态变化、结构、功能与机制的研究。


主要研究方向:
生物膜和膜蛋白的动态变化、结构、功能与机制的研究。

目前在研
基金项目:

1. 国家青年千人基金

1项

2. 国家自然科学基金

1项

3. 国家自然科学基金优秀青年基金

1项

 

4. 协和特聘教授基金

1项

 

5. 协和青年骨干基金

1项

 

6. 所院长基金

1项


课题组负责人简介:

石磊,男,博士“协和学者”特聘教授。2006年毕业于中国协和医科大学基础医学研究所,生化及分子生物学专业。2007-2012年在耶鲁大学进行博士后研究。2014年作为协和学者特聘教授回国,入选中组部“青年千人”项目。2015年获“求是青年学者奖”,2016年获得“国家自然基金优秀青年基金”。现为美国细胞生物学会会员专业会员 。中国生物物理学会生物膜及细胞生物学专业委员会委员。近12年以来,一直从事膜蛋白的功能、机制以及生物膜的相关研究工作,积累了丰富的研究经验,掌握了国内外相关先进研究技术和方法。

博士后期间参与多项NIH资助的研究课题,在Dr.James. E Rothman(2013年诺贝尔奖得主)实验室得到了良好的培养和训练,取得了一系列重要的研究结果,这些成果分别发表于Sicnece,Nature Protocol,PNAS,Mol. Biol. Cel.,BMC Biol.等杂志上。目前,在SCI杂志发表文章共计7篇,其中第一作者的文章5篇(含共同第一作者)。研究成果获得了同行的关注,其中在SNARE蛋白介导的膜融合方面的研究,受到了同行的高度关注和好评,由Fculty of 1000推荐,美国著名杂志The Scientist也对该研究进行了报道。

联系方式:E-mail: shilei@ibms.pumc.edu.cn
电 话:010-69156445


大学开始受教育经历
• 1997 年-2001 年,武汉大学,生命科学学院生物学人才培养基地班,大学本科,理学学士,在校期间多次获得校“人民奖学金”。
• 2001 年-2006 年,中国协和医科大学基础医学研究所,生化及分子生物学系,博士研究生,理学博士,在校期间获得校“优秀研究生”称号。博士期间研究课题为神经营养因子细胞膜受体介导的信号转导,取得了一些成果,分别发表在Cell Signal.,BMC Biol.等杂志上。

研究工作经历
• 2007年-2012年,在Dr.James. E Rothman(2013年诺贝尔奖得主)实验室(哥伦比亚大学生理及细胞生物物理系,后实验室搬至耶鲁大学细胞生物学系)进行博士后研究;研究方向为SNARE介导的膜融合的分子机制,取得重要研究成果,获得好评与推荐,成果分别发表在Science,Nature Protocol,Mol. Biol. Cell.等杂志上;
• 2013年-2014年,纽约大学Skirball研究所分子神经生物,Associate Research Scientist,研究方向为膜蛋白Lrp4参与的神经肌肉接头的发育分化;
• 2014年-目前,中国医学科学院基础医学研究所,“协和学者”特聘教授。
  现为中国生物物理学会生物膜及细胞专业委员会委员。

发表文章:

1. Shi L, Shen QT, Alexander Kiel, Wang J, Wang HW, Melia TJ, Rothman JE, Frédéric Pincet. SNARE Proteins: One to Fuse and Three to Keep the Nascent Fusion Pore Open.
Science, 2012 Mar 16, 355:1355-1359. (由美国《科学家》杂志(The Scientist)报道,并被Faculty 1000推荐) IF:31.77
2. Shi L*, Kevin Howan*, Qingtao Shen, Yong Jian Wang, James E. Rothman, Frédéric Pincet. Preparation and characterization of SNARE-containing nanodiscs and direct study of cargo release through fusion pores.
Nature Protocol, in press.( * these authors contribute equally) IF:8.36
3. Shi L, Kümmel D, Coleman J, Melia TJ, Giraudo CG. Dual roles of Munc18-1 rely on distinct binding modes of the central cavity with Stx1A and SNARE complex.
Mol Biol Cell. 2011 Nov;22(21):4150-60. IF:5.86
4. Li W*, Shi L*, You Y, Gong Y, Yin B, Yuan J, Peng X. Downstream of tyrosine kinase/docking protein 6, as a novel substrate of tropomyosin-related kinase C receptor, is involved in neurotrophin 3-mediated neurite outgrowth in mouse cortex neurons.
BMC Biol. 2010 Jun 18;8:86. ( * these authors contribute equally) IF:5.2
5. Lavieu G, Orci L, Shi L, Geiling M, Ravazzola M, Wieland F, Cosson P, Rothman JE. Induction of cortical endoplasmic reticulum by dimerization of a coatomer-binding peptide anchored to endoplasmic reticulum membranes.
Proc Natl Acad Sci U S A. 2010 Apr 13;107(15):6876-81. IF:9.68
6. Shi L*, Yue J*, You Y, Yin B, Gong Y, Xu C, Qiang B, Yuan J, Liu Y, Peng X. Dok5 is substrate of TrkB and TrkC receptors and involved in neurotrophin induced MAPK activation.
Cell Signal. 2006 Nov;18(11):1995-2003. ( * these authors contribute equally) IF:4.24
7. Gong Y, Wang X, Liu J, Shi L, Yin B, Peng X, Qiang B, Yuan J. NSPc1, a mainly nuclear localized protein of novel PcG family members, has a transcription repression activity related to its PKC phosphorylation site at S183.
FEBS Lett. 2005 Jan 3;579(1):115-21. IF:3.6
8.  Yali Ci, Kejian Shi, Lei Shi L*, CM Xu*. ROS inhibit autophagy by down-regulating ULK1 mediated by the phosphorylation of P53 in selenite-treated NB4 cells.
Cell Death and Disease (2014) 5, e1542; doi:10. 1038/cddis.2014.506.
9.  Kaiyan Hui, Yang Yang , Lei Shi, Caimin Xu *.The p38 MAPK-regulated PKD1/CREB/Bcl-2 pathway contributes to selenite-induced colorectal cancer cell apoptosis in vitro and in vivo.
Cancer Lett. 2014 ;1;354(1):189-199
10. Yang Y, Luo H, Hui K, Ci Y, Shi K, Chen G, Shi L* , Xu CM*. Selenite-induced autophagy antagonizes apoptosis in colorectal cancer cells in vitro and in vivo.
Oncol Rep.2016;35(3):1255-1264

课题组成员

姓名

性别

职称

电话

联系方式

石磊

研究员

69156445

shilei@ibms.pumc.edu.cn

许彩民

研究员

69156445

cmxu@ibms.pumc.edu.cn

杨洋

副主任技师

69156414

yangy@ibms.pumc.edu.cn

刘文杰

博士后,助研

69156414

Wenjie6363@163.com

慈雅丽

博士生

69156414

Dsyiing_495@163.com

魏雪菊

博士生

69156414

xuejuwei@126.com

徐杉

硕士生

69156414

1321939286@qq.com

张晓迪

直博生

69156414

xiaodiz@foxmail.com

王蕾杰

硕士生

69156414

15764210545@163.

姚彬

直博生

69156414

 

孙志超

技师

69156414

917907097@qq.com

 

课题组主要成员简介:

 

    许彩民,研究员(教授),博士生导师。毕业于北京大学化学系。1974年以来一直在中国医学科学院基础医学研究所工作(其中,1987-1990年在美国北加州旧金山州立大学高技术研究中心进修三年。)四十年来一直从事血细胞生物膜结构与功能及血液病发病的分子机理及药物干预等领域的科研和教学工作。近十几年来主要从事肿瘤细胞凋亡与信号转导及基因表达与调控方面的研究工作。作为课题负责人先后主持国家自然科学基金,科技部“九五” 攻关项目, “973”子课题项目等国家级科研项目20余项。在不断取得研究成果的基础上,在国内外Cell Death Disease;Free Radical Biology and Medcine;J. Cellular Biochem;  Cancer Lletters; Mol Biol Cell;J of Alzheimers Disease;  Apoptosis;等核心杂志上发表论文140余篇。获国家教委和卫生部科技进步奖三项,发明专利一项。

    此外,还参加了七部学术著作的编写工作。现为基础医学与临床常务编委等。
    已培养硕、博研究生近30名。

    联系方式:E-mail: cmxu@ibms.pumc.edu.cn
    电 话:010-69156445


近几年发表的SCI研究论文如下:( * 号为通信作者)

  1. Yang Y, Luo H, Hui K, Ci Y, Shi K, Chen G, Shi L* , Xu CM*. Selenite-induced autophagy antagonizes apoptosis in colorectal cancer cells in vitro and in vivo.
    Oncol Rep.2016;35(3):1255-1264
  2. Yun Shen, Junjun Yang, Jing Zhao, Chang ji Xiao, Caimin Xu*, Yang Xiang. The switch from ER stress-induced apoptosis to autophagy via ROS-mediated JNK/p62 signals: A survival mechanism in methotrexate-resistant choriocarcinoma cells.
    Experimental Cell Reseach 2 015;10;334(2):207-18.
  3. Yali Ci, Kejian Shi, Lei Shi L*, CM Xu*. ROS inhibit autophagy by down-regulating ULK1 mediated by the phosphorylation of P53 in selenite-treated NB4 cells.
    Cell Death and Disease (2014) 5, e1542; doi:10. 1038/cddis.2014.506.
  4. Kaiyan Hui, Yang Yang , Lei Shi, Caimin Xu *.The p38 MAPK-regulated PKD1/CREB/Bcl-2 pathway contributes to selenite-induced colorectal cancer cell apoptosis in vitro and in vivo.
    Cancer Lett. 2014 ;1;354(1):189-199
  5. Jiang Q, Li F, Shi K, Wu P, An J, Yang Y, Xu CM*. Involvement of p38 in signal switching from autophagy to apoptosis via the PERK/eIF2α/ATF4 axis in selenite-treated NB4 cells.
    Cell Death Dis. (2014)5; 29;5:e1270. doi: 10.1038/cddis.2014.200.
  6. Shi KJ, An JJ, Shan L, Jiang Q, Li F, Ci YL, Wu P, Duan J, Hui KY, Yang Y, Xu CM*. Survivin-2B promotes autophagy by accumulating IKK alpha in the nucleus of selenite-treated NB4 cells.
    Cell Death and Disease 2014 Feb 20;5:e1071. doi: 10.1038/cddis.2014.34.
  7. Li Z, Shi K, Guan L, Yang Y, Xu CM*. Activation of p53 by sodium selenite switched human leukemia NB4 cells from autophagy to apoptosis.
    Oncol Res. 2014;21(6):325-331.
  8. P Wu, KJ Shi, JJ An, YL Ci, F Li, KY Hui, Y Yang and CM Xu*.The LEF1/CYLD axis and cIAPs regulate RIP1 deubiquitination and trigger apoptosis in selenitetreated colorectal cancer cells.
    Cell Death and Disease 2014, 5, e_; doi:10.1038/cddis.2014.13.
  9. JJ An, KJ Shi, W Wei, FY Hua, YL Ci, Q Jiang, F Li, P Wu, KY Hui, Y Yang and CM Xu*. The ROS/JNK/ATF2 pathway mediates seleniteinduced leukemia NB4 cell cycle arrest and apoptosis in vitro and in vivo.
    Cell Death and Disease 2013 4, e973; doi:10.1038/cddis.2013.475.
  10. Li Feng, Jiang Qian, Shi Kejian, Luo Hui, Yang Yang and XuCaimin*. RhoA modulating functional and physical interaction between ROCK1 and Erk1/2 in selenite induced apoptosis of leukaemia cells.
    Cell Death and Disease 2013 4;4:e708. doi: 10.1038/cddis.2013.243.
  11. Shi K, Jiang Q, Li Z, Shan L, Li F, An J, Yang Y, Xu C*. Sodium selenite alters microtubule assembly and induces apoptosis in vitro and in vivo.
    Journal of Hematology and Oncology 2013,6:7 doi:10.1186/1756-8722-6-7.
  12. Qian Jiang, Feng Li, Kejian Shi, Pa Wu, Jiajia An, Yang Yang, Caimin Xu*. ATF4 activation by the p38MAPK–eIF4E axis mediates apoptosis and autophagy induced by selenite in Jurkat cells.
    FEBS Letters 2013587 24202429.
  13. Hui Luo, Yang Yang, Jing Duan, Pa Wu, Qian Jiang, Caimin Xu*.AKT/FoxO3a/Bim signaling contributes to reactive oxygen species-mediated apoptosis in selenite-treated colorectal cancer cells.
    Cell Death and Disease 2013;7(4):e481. doi: 10.1038/cddis.2013.3.
  14. Hui Luo, Yang Yang, Fang Huang, Feng Li, Qian Jiang, Kejian Shi, Caimin Xu*. Selenite induces apoptosis in colorectal cancer cells via AKT-mediated inhibition of b-catenin survival axis.
    Cancer Letters 2012; 315: 78-85
  15. Qian Jiang, Feng Li, Kejian Shi, Yang Yang & Caimin Xu *.Sodium selenite-induced activation of DAPK promotes autophagy in human leukemia HL60 cells.
    BMB reports 2012; 45(3):194-199.
  16. Qian Jiang, Yuhan Wang, Tianjiao Li,Kejian Shi,Zhushi Li, Yushi Ma, Feng Li,HuiLuo, Yang Yang,and Caimin Xu*.Hsp90-mediated inactivation of NFκB switches autophagy to apoptosis through becn1 transcriptional inhibition in selenite-induced NB4 cells.
    Mol Biol Cell 2011;22(8):1167-80.
  17. Zhang li Wu,Yong Dong,Li Peng,Tu Jun Niu,Ying Lin,Caimin XuZhang shu Tian Effects of cyloxygenase-2 on human esophageal sequamous cell carcinoma
    World Joural of Gastroenterolgy 2011,17,(41)4572-80
  18. Zhushi Li, Kejian Shi, Liying Guan, Tingming Cao, Qian Jiang, Yang Yang, Caimin Xu*. ROS leads to MnSOD upregulation through ERK2 translocation and p53 activation in selenite-induced apoptosis of NB4 cells.
    FEBS Letters 584 (2010) 2291–2297.
  19. Fang Huang, Chunlai Nie, Yang Yang, Wen Yue, Yun Ren, Xiaohui Wang, Haijing Jin, Caiming Xu* Quan Chen* Selenite induces redox dependent Bax activation and apoptosis in colorectal cancer cells.
    Free Radical Biology and Medcine 20092009;46;(8)1185-1195.
  20. Yingying zhu; Daofeng Ni*; Caimin Xu*.Gene expression profiles in the olfactory blulb from and rat model of Alzheimor’s disease.
    Journal of Alzheimer’s Disease 2009183581-593.
  21. Liying Guan Binshe Han Zhushi Li Fangyua Hua Æ Fang Huang Wei Wei Yang Yang Caimin Xu* . Sodium selenite induces apoptosis by ROS-mediated endoplasmic reticulum stress and mitochondrial dysfunction in human acute promyelocytic leukemia NB4 cells .
    Apoptosis. 2009 ;14(2):218-25.
  22. Guan L, Han B, Li J, Li Z, Huang F, Yang Y, Xu Caimin*. Exposure of human leukemia NB4 cells to increasing concentrations of selenite switches the signaling from pro-survival to pro-apoptosis.
    Ann Hematol. 2009;88(8):733-42.
  23. Bingshe Han, Yun Ren, Liying Guan,Yang Yang and XuCaimin*.Sodium selenite induces apoptosis in acute promyelocytic leukemia-derived NB4 cells through mitochondria-dependent pathway.
    Oncology Research 2009;17(8):373-81.
  24. Liying Guan , Qian Jiang , Zhushi Li , Fang Huang, Yun Ren, Yang Yang, Caimin Xu * Selenite induces apoptosis by mediating the release of MnSOD from mitochondria to cytosol in leukemia cells.
    BMB Reports 2009;30;42(6):361-6
  25. Yang Yang,Lan Chen,Tao Yang,Bing-She Han, Xu Caimin* Glycosylation Modification of Human Prion Protein Provokes Apoptosis in HeLa Cells in vitro.
    BMB repotr 2009;vol42;331-337.
  26. Yang Yang, Fang Huang, Yun Ren, Lu Xing, Ying Wu, Huazhen Pan,and Xu Caimin*.The anticancer effects of sodium selenite and selenomethionine on human colorectal carcinoma cell lines in nude mice.
    Oncology Research 20091811-8.
  27. Yun ren, fang huang, yuanliu,yang yang;qiang jiang,li ying,and XuCaimin*Autophagy inhibition through PI3K/AKT increases apoptosis by sodium selenite in NB4 cells
    BMB Reports 2009;42(9)599-604
  28. Li P; Zhang ST; Yu ZL;Wu YD; liu X; Xu CM; Cho CH. Effects of cycloxygenase-2 non-selective and selective inhibitors on proliferation inhibition and apoptosis induction of esophageal squamous carcinoma cells
    Dis Esophaqus 2009;22(1):21-31.
  29. Guan L, Huang F, Li Z, Han B, Jiang Q, Ren Y, Yang Y, XuCaimin*. P53 transcription-independent activity mediates selenite-induced acute promyelocytic leukemia NB4 cell apoptosis.
    BMB Reports 2008 31;41(10):745-50.
  30. Bingshe Han, Wei Wei, Fangyuan Hua, Tingming Cao, Hua Dong, Tao Yang,Yang Yang, Huazhen Pan, and Caimin Xu* Requirement for ERK Activity in Sodium Selenite-induced Apoptosis of Acute Promyelocytic Leukemia-derived NB4 Cells.
    Journal of Biochemistry and Molecular Biology.2007; 40, ( 2) 196-204.
  31. Lan Chen, Yang Yang, and Cai-MinXu,* Removal of the Glycosylation of Prion Protein Provokes Apoptosis in SF126.
    Journal of Biochemistry and Molecular Biology, 2007; 40, ( 5) 662-669
  32. Hua Dong,Tianyi Ying,Yang Yang,Jiangang ,Caimin Xu* comparative proteomic analysis of apoptosis induced by sodium selenite in human acute promyelocytic leukemia NB4 cells.
    J. Cellular Biochem. 2006 , 98:1495-1506.
  33. Tingmin Cao,Fang yuan Hau,Caimin Xu*,Yang Yang,Hua zhen Pan,Zhi nan Zhang An analysis of the different effects that defferent concentrations of selenium have on NB4 cells and identification of differentially expressed genes after sodium selenite treatment via cDNA microarray.
    Annal of Hematolgy 2006,85434442
  34. Yang Yang, Jian Wang, Caimin Xu*, Huazhen Pan, Zhinan Zhang Maltol Inhibits Apoptosis of Human Neuroblastoma Cells Induced by Hydrogen Peroxide.
    Journal of Biochemistry and Molecular Biology,2006;39;(2),145-149.
  35. Cailing Lu, Feichan Qiub,Haijun Zhoua, Yong Penga, Wei Haoc, Jialin Xua, Caimin Xu*, Xiaozhong Peng.Identification and characterization of selenoprotein K: An antioxidant in cardiomyocytes
    FEBS Letters 2006 ;580; 5189–197.

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