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生物化学与分子生物学系

石磊



石磊,中国医学科学院基础医学研究所、北京协和医学院 “协和学者”特聘教授,博士生导师。2001年毕业于武汉大学生命科学学院,获学士学位,2006年毕业于中国协和医科大学基础医学研究所生化及分子生物学专业,获博士学位。2007-2012年在耶鲁大学、纽约大学进行博士后研究,2014回国加入基础所工作,获国自然基金委“优青”基金、面上基金支持,并获2015年度“求是杰出青年学者奖”。担任中国生物物理学会生物膜生物学专业分会理事。近年来一直从事膜蛋白的功能与机制、囊膜病毒感染复制的相关研究。

邮箱: shilei@ibms.pumc.edu.cn 

 

实验室介绍

本实验室1978年由潘华珍教授创建,主要研究膜脂膜蛋白相互作用分子机理及红细胞膜异常的血液病分子机理研究。1993年许彩民教授接课题组后继续此方向的研究,同时开始进行肿瘤细胞凋亡与信号转导及基因表达与调控方面的研究,取得了良好的研究进展,发表了一系列的SCI学术研究论文。2014年石磊教授接任课题组长,继续开展膜蛋白和生物膜相关研究,目前实验室以RNA囊膜病毒为研究对象,研究病毒感染复制的机制以及与宿主细胞相互作用。


 

课题组人员: 

        许彩民,研究员(教授),博士生导师。毕业于北京大学化学系。1974年以来一直在中国医学科学院基础医学研究所工作(其中,1987-1990年在美国北加州旧金山州立大学高技术研究中心进修三年。)四十年来一直从事血细胞生物膜结构与功能及血液病发病的分子机理及药物干预等领域的科研和教学工作。近十几年来主要从事肿瘤细胞凋亡与信号转导及基因表达与调控方面的研究工作。作为课题负责人先后主持国家自然科学基金,科技部“九五” 攻关项目, “973”子课题项目等国家级科研项目20余项。在不断取得研究成果的基础上,在国内外Cell Death DiseaseFree Radical Biology and MedcineJ. Cellular Biochem;  Cancer Letters Mol Biol CellJ of Alzheimers Disease;  Apoptosis;等核心杂志上发表论文140余篇。获国家教委和卫生部科技进步奖三项,发明专利一项。

联系方式:E-mail: cmxu@ibms.pumc.edu.cn 


杨洋,硕士,副主任技师。

  

代表性文章 :

1.  Zika NS1–induced ER remodeling is essential for viral replication.  Yali Ci, ZhongYu Liu, NaNa Zhang, Yuqiang Niu, Yang Yang, Caimin Xu, Wei Yang#, ChengFeng Qin#, and Lei Shi#. J. Cell Biol.  2020, 219 (2): e201903062.

2.  Zika virus NS3 is a canonical RNA helicase stimulated by NS5 RNA polymerase.  Shan Xu, Yali Ci, Leijie Wang, Yang Yang, Leiliang Zhang , Caimin Xu Chengfeng Qin and Lei Shi#. Nucleic Acids Research.  2019, Vol. 47, No. 16 8693–8707.

3.  Zika NS2B is a crucial factor recruiting NS3 to the ER and activating its protease activity. Huaipeng Xing, Shan Xu, Fangfei Jia, Yang Yang, Caimin Xu, Chengfeng Qin#Lei Shi#.  Virus Research.  275 (2020) 197793.

4.  Vesicular stomatitis virus G protein transmembrane region is crucial for the hemi-fusion to full fusion transition.  Yali Ci, Yang Yang, Caimin Xu, Lei Shi#.  Sci Rep.  2018 Jul 13;8(1):10669.

5.  ROS inhibit autophagy by downregulating ULK1 mediated by the phosphorylation of p53 in selenite-treated NB4 cells. Ci Y, Shi K, An J, Yang Y, Hui K, Wu P, Shi L#, Xu C#. Cell Death Dis.  2014 Nov 27;5:e1542.

6.  Selenite-induced autophagy antagonizes apoptosis in colorectal cancer cells in vitro and in vivo.  Yang Y, Luo H, Hui K, Ci Y, Shi K, Chen G, Shi L#, Xu CM#.
Oncol Rep.  2015 Dec 10. doi: 10.3892/or.2015.4484.

7.  SNARE Proteins: One to Fuse and Three to Keep the Nascent Fusion Pore Open.  Shi L, Shen QT, Alexander Kiel, Wang J, Wang HW, Melia TJ, Rothman JE, Frédéric Pincet.  Science.  2012 Mar 16, 355:1355-1359. (由美国《科学家》杂志(The Scientist)报道,并被Faculty 1000推荐)

8.  Preparation and characterization of SNARE-containing nanodiscs and direct study of cargo release through fusion pores.  Shi L*, Kevin Howan*, Qing-tao Shen, Yong Jian Wang, James E. Rothman, Frédéric Pincet.
Nature Protocols.  2013 May;8(5):935-48. ( * these authors contribute equally).

9.  Dual roles of Munc18-1 rely on distinct binding modes of the central cavity with Stx1A and SNARE complex.  Shi L, Kümmel D, Coleman J, Melia TJ, Giraudo CG. 
Mol Biol Cell.  2011 Nov;22(21):4150-60.

10. Downstream of tyrosine kinase/docking protein 6, as a novel substrate of tropomyosin-related kinase C receptor, is involved in neurotrophin 3-mediated neurite outgrowth in mouse cortex neurons.   Li W*, Shi L*, You Y, Gong Y, Yin B, Yuan J, Peng X.
BMC Biol.  2010 Jun 18;8:86. ( * these authors contribute equally).

11. Dok5 is substrate of TrkB and TrkC receptors and involved in neurotrophin induced MAPK activation.  Shi L, Yue J, You Y, Yin B, Gong Y, Xu C, Qiang B, Yuan J, Liu Y, Peng X.
Cell Signal.  2006 Nov;18(11):1995-2003.