中国医学科学院基础医学研究所、中国协和医科大学基础医学院（以下简称所院）成立于1978年，其前身为中国医学科学院实验医学研究所（1958年成立）。所（院）现有正副教授104人，其中中国科学院院士4人，中国工程院院士2人。所（院）以学科建设为基础，重视科研发展和人才培养。现有15个学系和一个对国内外开放的医学分子生物学国家重点实验室，承担着科研和教学两大任务。科研方面侧重于疾病相关基因、功能基因组、基因表达调控、蛋白质组学、分子免疫以及医学遗传等方面的基础性研究，同时也注重开发具有自主知识产权的生物医药高新技术产品。教学方面承担着协和医科大学八年制医学本科生和硕、博士研究生的教学任务，是国家首批批准的博士学位和硕士学位授予单位，现有博士生导师52名，硕士生导师34名，在读研究生300多人，并建立了基础医学博士后流动站。生化及分子生物学、药理学、细胞生物学、医学遗传学、免疫学和病理-病理生理学为国家重点学科点。
　　所（院）的总体发展目标是建成国家级的基础医学创新研究基地，高级医学人才培养基地和生物医药高新技术产品的研发基地。所（院）将以“严谨、博精、创新、奉献”的精神，为实现这个目标而努力奋斗。