中国医学科学院基础医学研究所（以下简称“基础所（院）”）第十一届工会委员会（2021年11月换届）组织架构为：工会主席1人、工会副主席1人，工会委员会委员7人；经审委员会委员3人，女工委员会委员3人；提案工作委员会委员3人，民主评议干部工作委员会委员3人。

基础所（院）工会设有1个分工会（微循环研究所分工会），以及30个工会组（工会组以学系/中心/部门为单位进行分组）。

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